研究人员描述了质谱分析的进展以改善糖肽的鉴定

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糖基化是通过酶促反应将碳水化合物附着到蛋白质的主链上。它在确定蛋白质结构、功能和稳定性方面发挥着关键作用。糖基化的蛋白质称为糖蛋白。两种最常见的蛋白质糖基化类型称为N-糖基化和O-糖基化。

波士顿大学Chobanian&Avedisian医学院的研究人员进行的一项新研究着手改进识别糖肽的现有方法,发现传统的质谱方法足以识别具有一个聚糖的肽(服务于结构、能量储存和系统调节的重要生物分子)目的),但需要一个额外的步骤来识别具有两个或多个聚糖的肽。

由于一种蛋白质可以携带许多聚糖,因此很难或不可能生成仅携带一种聚糖的肽。识别具有多个聚糖的肽的能力是定义蛋白质的不同糖型以了解其生物学功能和在疾病中的作用的关键。

由于缺乏有关糖蛋白及其在发育和疾病过程中如何变化的信息,通讯作者、生物化学和细胞生物学研究助理教授ManveenK.Sethi博士认为,他们可能错过了有希望的治疗途径。“对糖基化如何影响疾病,特别是位点特异性改变的更彻底和具体的了解,可能会为目前缺乏有效治疗选择的疾病提供新的靶标,”她说。

Sethi解释说:“技术进步可以自信地识别密集糖基化肽,这将有助于根据位点特异性糖基化区分健康和患病状态,从而使糖蛋白能够用作不同疾病的标记物和治疗靶点。”

使用四种不同的标准蛋白质,研究人员在质谱分析之前遵循不同的酶消化方案。对于质谱分析,他们使用了传统的高能碰撞解离(HCD)方法,并将其与最近开发的方法——电子转移/高能碰撞解离(EThcD)进行了比较。然后,他们比较了不同消化方案和质谱方法中鉴定出的糖肽的数量。

虽然他们发现HCD足以识别糖肽,但EThcD通常是寻找聚糖所必需的,特别是在多糖基化肽的情况下。